Wojewódzki Inspektorat Ochrony Środowiska z siedzibą w Krakowie obejmuje swoim zasięgiem działania obszar województwa małopolskiego.

WIOŚ w Krakowie nadzoruje powiaty: chrzanowski, krakowski, miechowski, myślenicki, olkuski, oświęcimski, suski, wadowicki, wielicki, miasto Kraków,
Delegatura w Tarnowie nadzoruje powiaty: bocheński, brzeski, dąbrowski, proszowicki, tarnowski, Tarnów – miasto na prawach powiatu,
Delegatura w Nowym Sączu nadzoruje powiaty: gorlicki, limanowski, nowotarski, tatrzański, nowosądecki, Nowy Sącz – miasto na prawach powiatu.